MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl33

Total Repeats: 1015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011253	ATA	2	6	2	7	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011253	ATT	2	6	40	45	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011253	AAG	2	6	64	69	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011253	ACA	2	6	115	120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011253	A	6	6	146	151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011253	A	6	6	158	163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011253	ATAAA	2	10	270	279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011253	TAAA	3	12	276	287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011253	TAA	2	6	347	352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011253	ACTT	2	8	530	537	25 %	50 %	0 %	25 %	203288383
11	NC_011253	AATT	2	8	557	564	50 %	50 %	0 %	0 %	203288383
12	NC_011253	ATCT	2	8	642	649	25 %	50 %	0 %	25 %	203288383
13	NC_011253	AATC	2	8	659	666	50 %	25 %	0 %	25 %	203288383
14	NC_011253	ATC	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288383
15	NC_011253	CAT	2	6	708	713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288383
16	NC_011253	GAA	2	6	722	727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288383
17	NC_011253	ATA	2	6	750	755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288383
18	NC_011253	TAT	2	6	782	787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288383
19	NC_011253	T	6	6	795	800	0 %	100 %	0 %	0 %	203288383
20	NC_011253	CT	3	6	803	808	0 %	50 %	0 %	50 %	203288383
21	NC_011253	TTAT	2	8	826	833	25 %	75 %	0 %	0 %	203288383
22	NC_011253	ATC	2	6	840	845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288383
23	NC_011253	AATT	2	8	846	853	50 %	50 %	0 %	0 %	203288383
24	NC_011253	TAAT	2	8	916	923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011253	ATA	2	6	930	935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011253	ATT	2	6	943	948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011253	A	6	6	963	968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011253	TAA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011253	CAA	3	9	978	986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011253	ATA	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011253	TTA	2	6	1036	1041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011253	A	7	7	1074	1080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011253	ATT	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011253	T	6	6	1110	1115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011253	T	6	6	1117	1122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011253	CTCCTT	2	12	1153	1164	0 %	50 %	0 %	50 %	203288384
37	NC_011253	ATT	2	6	1212	1217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288384
38	NC_011253	CTTC	2	8	1240	1247	0 %	50 %	0 %	50 %	203288384
39	NC_011253	T	6	6	1250	1255	0 %	100 %	0 %	0 %	203288384
40	NC_011253	TCT	2	6	1270	1275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288384
41	NC_011253	AAT	2	6	1278	1283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288384
42	NC_011253	ACC	2	6	1418	1423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011253	ATC	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011253	TAC	2	6	1472	1477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011253	TA	3	6	1483	1488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011253	TTA	2	6	1518	1523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011253	ATATTT	2	12	1565	1576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011253	AAG	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011253	AT	3	6	1604	1609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011253	A	6	6	1611	1616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011253	TA	3	6	1627	1632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011253	TAA	2	6	1638	1643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011253	TAT	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011253	ATC	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288385
55	NC_011253	AAT	2	6	1703	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288385
56	NC_011253	T	6	6	1765	1770	0 %	100 %	0 %	0 %	203288385
57	NC_011253	CAATC	2	10	1804	1813	40 %	20 %	0 %	40 %	203288385
58	NC_011253	TCT	2	6	1838	1843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288385
59	NC_011253	TTC	2	6	1919	1924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288385
60	NC_011253	CTTT	2	8	1936	1943	0 %	75 %	0 %	25 %	203288385
61	NC_011253	T	8	8	1941	1948	0 %	100 %	0 %	0 %	203288385
62	NC_011253	ATA	2	6	1968	1973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288385
63	NC_011253	ATACT	2	10	2001	2010	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011253	TGT	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011253	TC	3	6	2053	2058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011253	TAA	2	6	2075	2080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011253	CAA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011253	A	6	6	2129	2134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011253	TTAG	2	8	2153	2160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011253	AAT	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011253	ATA	2	6	2219	2224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011253	TA	3	6	2241	2246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011253	TAA	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011253	ATTTA	2	10	2334	2343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011253	AAC	2	6	2390	2395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011253	TTC	2	6	2426	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011253	TTG	2	6	2520	2525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011253	TTA	2	6	2557	2562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011253	GAT	2	6	2574	2579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011253	T	6	6	2599	2604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011253	ATTC	2	8	2728	2735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011253	ATC	2	6	2768	2773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011253	TAT	2	6	2794	2799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011253	AATA	2	8	2800	2807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011253	AAT	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011253	TAT	2	6	3023	3028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011253	TTA	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011253	TC	3	6	3040	3045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011253	TTTCTT	2	12	3061	3072	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011253	T	7	7	3090	3096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011253	TAC	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011253	TAA	2	6	3118	3123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011253	CCA	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011253	TTA	2	6	3178	3183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011253	AAATT	2	10	3261	3270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011253	ATT	2	6	3276	3281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011253	TTA	2	6	3295	3300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011253	AC	4	8	3308	3315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011253	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011253	ATT	2	6	3438	3443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011253	AT	3	6	3448	3453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011253	GTT	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011253	TTA	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011253	ATTT	2	8	3583	3590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011253	ATT	2	6	3599	3604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011253	CTTG	2	8	3606	3613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011253	CCA	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011253	CAC	2	6	3651	3656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011253	CAA	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011253	T	7	7	3709	3715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011253	CAT	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011253	ACCA	2	8	3812	3819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011253	CTT	2	6	3862	3867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011253	T	7	7	3971	3977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011253	TCT	2	6	3979	3984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011253	CTA	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011253	TC	3	6	4005	4010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011253	CAC	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_011253	TAC	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011253	CTG	2	6	4109	4114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011253	AAC	2	6	4147	4152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011253	TAG	2	6	4187	4192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011253	CATT	2	8	4204	4211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011253	TAC	3	9	4221	4229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011253	AAT	2	6	4230	4235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011253	TAAA	2	8	4248	4255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011253	TA	4	8	4256	4263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011253	AAT	3	9	4324	4332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011253	CTAG	2	8	4346	4353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011253	CTC	2	6	4379	4384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_011253	CTTA	2	8	4388	4395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011253	CTT	2	6	4530	4535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011253	TGAT	2	8	4634	4641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011253	CA	3	6	4648	4653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011253	TAT	2	6	4654	4659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011253	TACAT	2	10	4703	4712	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011253	TCT	2	6	4719	4724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011253	TATAT	2	10	4749	4758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011253	T	6	6	4781	4786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011253	CAA	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011253	AAT	2	6	4814	4819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011253	TAA	2	6	4825	4830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011253	A	7	7	4829	4835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011253	CAC	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_011253	TCTT	2	8	4904	4911	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011253	TAACTT	2	12	4915	4926	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_011253	T	7	7	4929	4935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011253	TAT	2	6	4941	4946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011253	TA	3	6	4952	4957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011253	CCA	3	9	4971	4979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_011253	GAT	2	6	4995	5000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_011253	TTA	2	6	5023	5028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_011253	T	8	8	5131	5138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011253	CAT	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_011253	T	6	6	5363	5368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011253	ATC	2	6	5369	5374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_011253	AGT	2	6	5387	5392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011253	CAT	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_011253	ATC	2	6	5456	5461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_011253	CTT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_011253	ACC	2	6	5549	5554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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173	NC_011253	CTA	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_011253	CTA	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_011253	AAAT	2	8	6176	6183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_011253	AATTTA	2	12	6214	6225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_011253	T	6	6	6278	6283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_011253	TAA	2	6	6319	6324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_011253	AT	3	6	13976	13981	50 %	50 %	0 %	0 %	203288390
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440	NC_011253	CAAG	2	8	14040	14047	50 %	0 %	25 %	25 %	203288390
441	NC_011253	TGA	2	6	14055	14060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288390
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449	NC_011253	CTA	2	6	14249	14254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_011253	AAG	2	6	14261	14266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_011253	A	7	7	14292	14298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_011253	TA	3	6	14314	14319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_011253	TTTTAC	2	12	14337	14348	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
454	NC_011253	AT	3	6	14386	14391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_011253	TTA	2	6	14393	14398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_011253	TTA	2	6	14402	14407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_011253	T	6	6	14411	14416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_011253	A	6	6	14418	14423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_011253	T	6	6	14430	14435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_011253	A	8	8	14674	14681	100 %	0 %	0 %	0 %	203288391
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469	NC_011253	A	6	6	14987	14992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_011253	T	7	7	15002	15008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_011253	T	7	7	15019	15025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_011253	A	6	6	15105	15110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_011253	GTA	3	9	15149	15157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
474	NC_011253	ATA	2	6	15198	15203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_011253	TA	4	8	15269	15276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_011253	TAA	2	6	15284	15289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_011253	TTG	2	6	15356	15361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
481	NC_011253	AAT	2	6	15417	15422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_011253	TAA	2	6	15479	15484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_011253	TAAT	2	8	15554	15561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_011253	T	7	7	15613	15619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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